波掃描顯微鏡的換能器，它的工作焦距取決于被測材料的物理性質。由于不同的材料中聲速也不相同，因此換能器的焦距一般特指在水中的焦距。大多數材料中的聲速都大于水中的聲速，換能器的有效焦距均縮短了。造成這種效應的原因是聲波在界面上的折射，如下圖所示。

下式可以計算焦距的變化情況。

    其中WP代表水中的距離，MD代表聲波在材料中穿透的深度，F表示水中的焦距，Ctm，Cw分別表示被測材料及水中的聲速。
    例如，在特定的焦距及材料路徑下，上式可以用于計算為了補償焦距變化換能器到樣品表面的有效距離。